بررسی فیلوژنی مولکولی شقایق دریایی جنس Actiniaria: Actiniidae)Anemonia بر اساس توالی DNA میتوکندریایی (COI) در خلیج فارس
نویسندگان
چکیده مقاله:
در این مقاله، فیلوژنی مولکولی شقایق دریایی جنس (Actiniaria: Actiniidae) بر اساس توالی DNA میتوکندریایی (COI) در خلیج فارس مورد بررسی قرار گرفت. گونه مورد مطالعه در این تحقیق از جزیره لارک واقع در خلیج فارس جمع آوری شد وDNA آن استخراج و قسمتی از ژنCOI آن (حدود 700 جفت باز) با استفاده از دو پرایمرLCO1490 وHCO2198 به وسیلهPCR تکثیر داده شد و محصولPCR در دستگاه توالی یاب خودکارDNA به وسیله شرکتBioNEER توالی یابی گردید. توالی نوکلئیک اسید و پروتئین گرفته شده از ژنCOI به عنوان یک توالی جدید در ژن بانک گزارش شد. بر طبق این توالی شقایق خلیج فارس به عنوان یک گونه جدید با نامAnemonia sp. PG و شماره ثبتAB933643.1 در وب گاهNCBI قرار گرفت. هدف از این مطالعه شناسایی مولکولی شقایق خلیج فارس و انجام آنالیز مولکولی روی آن بود. در آنالیز مولکولی توالی قسمتی از ژنCOI میتوکندریایی گونهAnemonia sp. PG از خلیج فارس با 15 شقایق دریایی دیگر از بانک ژن که از لحاظ توالی ژنتیکی به گونه مورد بررسی نزدیک هستند مقایسه گردید. گونهMetridium senile به عنوان برون گونه در نظر گرفته شد. بررسی فیلوژنتیکی بر اساس آنالیزNeighbor-Joining رابطه خواهری بین گونهAnemonia sp. PG از ایران و گونهAnemonia sp. Anem را نشان داد ولی روابط منوفایلتیک بین خانوادههای شقایق دریایی را نشان نداد.
منابع مشابه
بررسی فیلوژنی مولکولی شقایق دریایی جنس actiniaria: actiniidae)anemonia بر اساس توالی dna میتوکندریایی (coi) در خلیج فارس
در این مقاله، فیلوژنی مولکولی شقایق دریایی جنس (actiniaria: actiniidae) بر اساس توالی dna میتوکندریایی (coi) در خلیج فارس مورد بررسی قرار گرفت. گونه مورد مطالعه در این تحقیق از جزیره لارک واقع در خلیج فارس جمع آوری شد وdna آن استخراج و قسمتی از ژنcoi آن (حدود 700 جفت باز) با استفاده از دو پرایمرlco1490 وhco2198 به وسیلهpcr تکثیر داده شد و محصولpcr در دستگاه توالی یاب خودکارdna به وسیله...
متن کاملبررسی فیلوژنی مولکولی جنس Linaria Mill. (Plantaginaceae) در ایران براساس توالی DNA کلروپلاستی
سابقه و هدف: جنس Linaria Mill. متعلق به خانواده Plantaginaceae از راسته Lamiales است. زیستگاه این جنس در نیمکره شمالی و در برخی نقاط ایران می باشد. هدف این تحقیق بررسی وضعیت تاکسونومی و یافتن روابط فیلوژنی این جنس در ایران می باشد. مواد و روش ها: مطالعات مولکولی مطابق با روش زیر انجام گرفت: 1- استخراج DNA کامل از برگ ها، 2- تکثیر و تعیین ترادف قطعه ناحیه rpl32-trnL از ژنوم کلروپلاستی،3- انجام...
متن کاملفیلوژنی مولکولی جنس Eumeces Wiegmann, 1834 (خزندگان: سینسیده) در ایران، براساس DNA میتوکندریایی ژن 16S
Phylogenetic relationships among the Eumeces schneiderii princeps and Eumeces schneiderii pavimentatus investigated using 509 bp partial sequences of 16S mitochondrial gene. Analyses were done by maximum-likelihood (RAxML) criteria on 52 specimens from over 20 geographically distinct localities. Our molecular results proposed two well-supported major clades by their phylogenetic positions, gene...
متن کاملفیلوژنی مولکولی جنس ( Rochelia (Boraginaceae بر اساس توالی های nrDNA ITS و cpDNA trnL-F
تعداد 8 گونه از جنس Rochelia و دو گونه از Lappula (به عنوان برون گروه) با استفاده از توالی هستهای ITS و توالی کلروپلاستی trnL-F به طور جداگانه و نیز به صورت ترکیبی آنالیز شدند. برای مشخص کردن روند تکامل صفات مورفولوژیکی، شش صفت تشخیصی بر روی درخت ترکیبی با استفاده از برنامه MacClade 4 نشان داده شد. آنالیز ها آشکار کرد که بخشه Rochelia به دلیل قرار گرفتن بخشه مونوتیپیک Cryptocarpa (Rochelia c...
متن کاملتنوع ژنتیکی میگوی سرتیز Metapenaeus affinis در خلیج فارس بر اساس توالی ژن میتوکندریایی 16S rRNA
میگوی سرتیز رتبه دوم میزان صید میگوی را در استان هرمزگان داشته و در چرخه صید و صیادی خلیج فارس اهمیت زیادی دارد. از این رو، بررسی تنوع ژنتیکی این گونه مهم مد نظر قرار گرفت. نمونههای میگو از سه منطقه بندرعباس، بوشهر و آبادان جمعآوری شدند و برای توالییابی ژن میتوکندریایی 16S rRNA مورد بررسی قرار گرفتند. بهینهسازی واکنش PCR جهت تکثیر ژن انجام شد. نتایج توالییابی ژن 16S rRNA که شامل 486 باز هم...
متن کاملشناسایی مولکولی و فیلوژنی گونههای جنس Nerita در سواحل صخرهای شمال خلیج فارس
در این پژوهش شناسایی مولکولی گونههای جنس Nerita، شامل N. lognii، N. albicilla و N. polita، در سواحل شمالی خلیجفارس به همراه بررسی مورفولوژیک آنها انجام شد. این جنس متعلق به خانواده Neritidae بوده و از گونههای غالب شکمپایان سواحل صخرهای میباشد. نمونهبرداری در سالهای 92 و 93 در سواحل صخرهای صورت گرفت. نمونهها مورد شناسایی مورفولوژیک قرار گرفتند و سپس مراحل استخراج DNA (با استفاده از پو...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 6 شماره 24
صفحات 77- 83
تاریخ انتشار 2016-01
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
کلمات کلیدی برای این مقاله ارائه نشده است
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023